秘卷是能显著影响战局的关键辅助技能，其选择直接关系到忍者的发挥上限。秘卷本身没有品质区分，所有秘卷都需5个碎片激活，之后通过消耗碎片提升等级，增强伤害、缩短冷却并获得属性加成。获取秘卷碎片的基础途径是每日必刷的小队突袭玩法，这是稳定产出的主要渠道。限时活动、节日任务以及决斗场升段奖励也是重要的碎片来源，会随机掉落或提供特定碎片兑换机会。对于想快速成型的玩家，商城每周限购的疾风传秘卷礼包或直购特惠礼包是可选途径，但需根据自身资源权衡投入。
选择秘卷的核心在于匹配忍者特性，而非盲目追求高阶。秘卷大致分为攻击型、防御型和辅助型。攻击型如风杀阵、豪火灭却，能直接补足伤害；防御型如霸体、解术散，提供免控或反制能力；辅助型如气旋、冻雪，主要用于控制和干扰走位。对于依赖技能连招的爆发型忍者，携带查克拉秘卷可以刷新技能，保证输出节奏；主打远程消耗的忍者，则更适合气旋这类能控制距离、创造安全输出环境的秘卷；而那些自身缺乏保护手段的忍者，霸体或扦插之术能有效提升容错率，防止被对手轻易起手。关键在于分析你所使用忍者的短板，用秘卷进行弥补。
对战场景是影响秘卷选择的另一大因素。在竞技场玩法中，功能性秘卷往往更为重要，气旋可以打断对手突进，查克拉能确保关键时刻有奥义点，霸体则能应对各种先手控制。而在以刷怪为主的副本或组织战里，清图效率至上，这时豪火灭却、风杀阵等高伤害的范围型秘卷就更实用。还需考虑对手的常见阵容，如果当前环境下霸体忍者较多，那么携带一个解术散来针对性破解就会非常有效。换言之，秘卷搭配并非一成不变，需要根据你主要的玩法和对局环境进行灵活调整。
除了选择正确的秘卷类型，培养升级也同样重要。秘卷的等级提升会显著增强其效果，例如减少冷却时间、增加伤害或提高控制概率。高等级的秘卷在实战中能带来更频繁的进攻机会或更稳固的防御。培养资源主要来源于日常玩法积累，因此建议围绕你最常用的几套搭配进行重点升级。游戏内存在普通秘卷和疾风传秘卷的区分，部分稀有秘卷如气旋、雷电击无法通过常规小队突袭获取，它们依赖特定的活动、宝箱或积分兑换，在规划获取路径时需要特别留意。
